《深度学习与医学图像处理》阅读心得2
<div class='showpostmsg'> 本帖最后由 kkompp 于 2024-4-8 21:12 编辑<p> 本次阅读主要是关于书的第三章：数据标注。</p>
<p> </p>
<p>1 数据标注：数据标注的目标是为了提高深度学习的精度，本书主要介绍的标注软件是3D Slicer。</p>
<p> </p>
<p>2软件下载</p>
<p> 官网下载地址市：<a href="https://download.slicer.org" target="_blank">https://download.slicer.org</a>/</p>
<p> 打开后如图所示：</p>
<p> 这里我们不选最新版本，选择与书籍一样的版本4.11。其下载地址是：<a href="https://slicer-packages.kitware.com/#collection/5f4474d0e1d8c75dfc70547e/folder/60ac0ce2ae4540bf6a899ecc" target="_blank">https://slicer-packages.kitware.com/#collection/5f4474d0e1d8c75dfc70547e/folder/60ac0ce2ae4540bf6a899ecc</a></p>
<p> 打开后如图所示：</p>
<p> </p>
<p> 这里我们选择windows版本，也就是图中的第三个选项。下载安装即可。</p>
<p> </p>
<p>3 软件界面介绍</p>
<p> 打开软件后，可以看到如图所示界面</p>
<p> 与大部分的可编辑软件布局类似，左侧为操作节目，右侧为工作视图，上方有主菜单栏与工具栏。主菜单栏主要是：file，edit，view与help。</p>
<p>4 加载数据并进行编辑</p>
<p> 数据是DICOM数据，可以导入，本次学习采用软件提供的数据，通过download sample data获得，如图所示。</p>
<p> </p>
<p> 这里我们选择MRhead数据，下载后，如图所示</p>
<p> 点击 segment editor工具图标开始标注，如下图所示。添加segment，设置阈值，得到如书中的图所示。</p>
<p> 这里可以应用剪刀工具进行裁剪，如图所示。</p>
<p> 标注完成后，要进行保存，如图所示</p>
<p> </p>
<p>也可以进行导出操作，设置好导出后，进行保存，会出现多个选项如图所示。</p>
<p> </p>
<p>5 小结</p>
<p> 3D Slicer软件功能强大，用于医学图像处理、可视化、以及进行计算机辅助手术的研究和临床前应用。软件平台支持多模态成像，如CT、MRI和PET，以及生物医学研究。它能够进行图像分割、三维重建、导航和数据分析等功能。本次学习只是初步入门，后续需要对软件进行反复使用，学会更多功能。</p>
<p> </p>
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这东西，没有三年五年的临床经历，估计也摸不出什么东西。我本是医学高级职称，但是没有物理诊断的经验，也不敢入手。 winnipegtiger 发表于 2024-4-9 09:14
我也是搞这一块的，我也要好好学学。
<p>向您学习，共同进步</p>
lugl4313820 发表于 2024-4-9 10:03
这东西，没有三年五年的临床经历，估计也摸不出什么东西。我本是医学高级职称，但是没有物理诊断的经验，也 ...
<p>大佬说的太对了</p>
<p>数据标注也得手工标注吧，这就有点考验人了 </p>
秦天qintian0303 发表于 2024-4-10 08:46
数据标注也得手工标注吧，这就有点考验人了
<p>是的了，需要懂医学，至少需要懂怎么看医学图像</p>
秦天qintian0303 发表于 2024-4-10 08:46
数据标注也得手工标注吧，这就有点考验人了
<p>可以使用一些开源的标注的数据集</p>
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